Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtaP09225 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LtaP09225 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LtaP09225 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LtaP09225 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LtaP09225 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtaP09225 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtaP09225 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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