Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

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Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PtprcP06800 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprcP06800 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprcP06800 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PtprcP06800 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PtprcP06800 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprcP06800 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PtprcP06800 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PtprcP06800 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PtprcP06800 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprcP06800 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms