Protein–RNA interactions for Protein: P06329

Ig heavy chain V region AC38 15.3, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06329 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P06329 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06329 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06329 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06329 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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