Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CopeO89079 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CopeO89079 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CopeO89079 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CopeO89079 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CopeO89079 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CopeO89079 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CopeO89079 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CopeO89079 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CopeO89079 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CopeO89079 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CopeO89079 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CopeO89079 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CopeO89079 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CopeO89079 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CopeO89079 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CopeO89079 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CopeO89079 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CopeO89079 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CopeO89079 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CopeO89079 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CopeO89079 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CopeO89079 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CopeO89079 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CopeO89079 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CopeO89079 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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