Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms