Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cbx4O55187 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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