Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptpn20O55082 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms