Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cldn5O54942 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cldn5O54942 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Cldn5O54942 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Cldn5O54942 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cldn5O54942 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cldn5O54942 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cldn5O54942 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cldn5O54942 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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