Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx1aO35526 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms