Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kpna6O35345 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna6O35345 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms