Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm20878L7N244 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm20878L7N244 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm20878L7N244 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm20878L7N244 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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