Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Farp1F8VPU2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms