Protein–RNA interactions for Protein: F6WY25

Gm10271, Predicted gene 10271, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10271F6WY25 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10271F6WY25 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10271F6WY25 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms