Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm340F6RGI3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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