Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ccdc170D3YXL0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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