Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed5B2RPU8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms