Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uhrf1bp1B2KF50 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms