Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms