Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem238A9JSM3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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