Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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