Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn34dA2AGU5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms