Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm5114W4VSN8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm5114W4VSN8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5114W4VSN8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5114W4VSN8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms