Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3550W4VSN7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3550W4VSN7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3550W4VSN7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 493 ms