Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Homer1Q9Z2Y3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Homer1Q9Z2Y3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Homer1Q9Z2Y3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms