Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gria3Q9Z2W9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gria3Q9Z2W9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms