Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D6

Mecp2, Methyl-CpG-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mecp2Q9Z2D6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mecp2Q9Z2D6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mecp2Q9Z2D6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mecp2Q9Z2D6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mecp2Q9Z2D6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mecp2Q9Z2D6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mecp2Q9Z2D6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mecp2Q9Z2D6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mecp2Q9Z2D6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mecp2Q9Z2D6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mecp2Q9Z2D6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mecp2Q9Z2D6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mecp2Q9Z2D6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms