Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W4

Gdf11, Growth/differentiation factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf11Q9Z1W4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gdf11Q9Z1W4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gdf11Q9Z1W4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gdf11Q9Z1W4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gdf11Q9Z1W4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gdf11Q9Z1W4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gdf11Q9Z1W4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gdf11Q9Z1W4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gdf11Q9Z1W4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gdf11Q9Z1W4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gdf11Q9Z1W4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gdf11Q9Z1W4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gdf11Q9Z1W4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gdf11Q9Z1W4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gdf11Q9Z1W4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gdf11Q9Z1W4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gdf11Q9Z1W4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gdf11Q9Z1W4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gdf11Q9Z1W4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Gdf11Q9Z1W4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gdf11Q9Z1W4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gdf11Q9Z1W4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms