Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms