Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cog1Q9Z160 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cog1Q9Z160 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog1Q9Z160 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog1Q9Z160 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog1Q9Z160 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog1Q9Z160 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog1Q9Z160 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog1Q9Z160 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog1Q9Z160 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog1Q9Z160 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog1Q9Z160 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms