Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sh3bp5Q9Z131 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sh3bp5Q9Z131 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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Sh3bp5Q9Z131 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
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Sh3bp5Q9Z131 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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Sh3bp5Q9Z131 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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Sh3bp5Q9Z131 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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Sh3bp5Q9Z131 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sh3bp5Q9Z131 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3bp5Q9Z131 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
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