Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl8Q9Z121 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl8Q9Z121 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1637.9 ms