Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M6

Cd97, CD97 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd97Q9Z0M6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd97Q9Z0M6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd97Q9Z0M6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd97Q9Z0M6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd97Q9Z0M6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd97Q9Z0M6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd97Q9Z0M6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd97Q9Z0M6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd97Q9Z0M6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd97Q9Z0M6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd97Q9Z0M6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd97Q9Z0M6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd97Q9Z0M6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cd97Q9Z0M6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd97Q9Z0M6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms