Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx1Q9WV80 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snx1Q9WV80 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx1Q9WV80 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms