Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ArcQ9WV31 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ArcQ9WV31 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ArcQ9WV31 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms