Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srd5a3Q9WUP4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srd5a3Q9WUP4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srd5a3Q9WUP4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms