Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
AtrnQ9WU60 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AtrnQ9WU60 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AtrnQ9WU60 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AtrnQ9WU60 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AtrnQ9WU60 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
AtrnQ9WU60 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AtrnQ9WU60 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AtrnQ9WU60 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
AtrnQ9WU60 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
AtrnQ9WU60 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AtrnQ9WU60 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AtrnQ9WU60 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AtrnQ9WU60 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AtrnQ9WU60 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
AtrnQ9WU60 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AtrnQ9WU60 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AtrnQ9WU60 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AtrnQ9WU60 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AtrnQ9WU60 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AtrnQ9WU60 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AtrnQ9WU60 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AtrnQ9WU60 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AtrnQ9WU60 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
AtrnQ9WU60 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms