Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Scnn1gQ9WU39 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scnn1gQ9WU39 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scnn1gQ9WU39 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scnn1gQ9WU39 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scnn1gQ9WU39 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scnn1gQ9WU39 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scnn1gQ9WU39 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scnn1gQ9WU39 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scnn1gQ9WU39 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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