Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc2Q9R244 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc2Q9R244 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms