Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rfwd2Q9R1A8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfwd2Q9R1A8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfwd2Q9R1A8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms