Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ntn3Q9R1A3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ntn3Q9R1A3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms