Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc26a4Q9R155 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc26a4Q9R155 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc26a4Q9R155 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc26a4Q9R155 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms