Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ClnkQ9QZE2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ClnkQ9QZE2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClnkQ9QZE2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms