Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ChmlQ9QZD5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChmlQ9QZD5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ChmlQ9QZD5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChmlQ9QZD5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChmlQ9QZD5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChmlQ9QZD5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChmlQ9QZD5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChmlQ9QZD5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChmlQ9QZD5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChmlQ9QZD5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChmlQ9QZD5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChmlQ9QZD5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms