Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tspan3Q9QY33 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan3Q9QY33 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tspan3Q9QY33 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms