Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk1nQ9QXV0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcsk1nQ9QXV0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms