Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN0

Shroom3, Protein Shroom3, mousemouse

Predictions only

Length 1,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom3Q9QXN0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom3Q9QXN0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom3Q9QXN0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom3Q9QXN0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom3Q9QXN0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom3Q9QXN0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom3Q9QXN0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shroom3Q9QXN0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom3Q9QXN0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom3Q9QXN0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom3Q9QXN0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom3Q9QXN0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom3Q9QXN0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom3Q9QXN0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom3Q9QXN0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shroom3Q9QXN0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shroom3Q9QXN0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom3Q9QXN0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms