Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cpsf3Q9QXK7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpsf3Q9QXK7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpsf3Q9QXK7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms