Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dkk3Q9QUN9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dkk3Q9QUN9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms