Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RhoaQ9QUI0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RhoaQ9QUI0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RhoaQ9QUI0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RhoaQ9QUI0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RhoaQ9QUI0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RhoaQ9QUI0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RhoaQ9QUI0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RhoaQ9QUI0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RhoaQ9QUI0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RhoaQ9QUI0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RhoaQ9QUI0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RhoaQ9QUI0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RhoaQ9QUI0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RhoaQ9QUI0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RhoaQ9QUI0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RhoaQ9QUI0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RhoaQ9QUI0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RhoaQ9QUI0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms