Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cabp2Q9JLK4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cabp2Q9JLK4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cabp2Q9JLK4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cabp2Q9JLK4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cabp2Q9JLK4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cabp2Q9JLK4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cabp2Q9JLK4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cabp2Q9JLK4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cabp2Q9JLK4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp2Q9JLK4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp2Q9JLK4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp2Q9JLK4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp2Q9JLK4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp2Q9JLK4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp2Q9JLK4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp2Q9JLK4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cabp2Q9JLK4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cabp2Q9JLK4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cabp2Q9JLK4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms